Η αρχή λειτουργίας ενός εξειδικευμένου διαχωριστή βασίζεται κυρίως στη φυγόκεντρο δύναμη και τις διαφορές στις φυσικές ιδιότητες των υλικών για την επίτευξη στερεού-υγρού ή υγρού- διαχωρισμού υγρού. Η βασική διαδικασία μπορεί να χωριστεί σε τρία στάδια:
Αρχικά, τα υλικά που πρόκειται να διαχωριστούν εισέρχονται στον περιστρεφόμενο θάλαμο του διαχωριστή μέσω της εισόδου τροφοδοσίας.
Δεύτερον, η φυγόκεντρος δύναμη που δημιουργείται από την περιστροφή-με υψηλή ταχύτητα προκαλεί την εναπόθεση πυκνότερων στερεών σωματιδίων στην άκρη του θαλάμου, ενώ λιγότερο πυκνά υγρά εκκενώνονται μέσω του πλέγματος ή της εξόδου υπερχείλισης.
Τέλος, τα στερεά και τα υγρά του εξειδικευμένου διαχωριστή εξέρχονται μέσω διαφορετικών εξόδων εκκένωσης, ολοκληρώνοντας τη διαδικασία διαχωρισμού.